琼脂糖电泳结果分析
琼脂糖电泳结果分析
琼脂糖凝胶电泳这样跑的原因是什么?
为什么琼脂糖凝胶电泳的条带是弯曲的?
琼脂糖凝胶有网状组织,网状组织的亲和力取决于琼脂糖的浓度值。核酸结构在琼脂糖凝胶中电泳时,具有正电荷效应和碳分子筛效应,游动时受到摩擦阻力。琼脂糖凝胶的浓度值要根据你的目标条带长度来调整,一般在0.5~2\%之间。低浓度凝胶用于大面积核酸电泳,高浓度凝胶用于小片段核酸分析。因此,琼脂糖浓度值危及核酸分子结构的“运行”速度。在我们实验室,目的磁带一般小于1kb,大家用的都是1\%胶水。对于模糊、弥散的条带,可能是由于以下原因:1)电泳缓冲液多次使用后,离子浓度相对较低,pH值升高,缓冲特性下降,可能导致条带转移模糊不规则。2)加样过多可能导致条带模糊,加样过少可能导致条带微弱甚至缺失。3)工作电压和温度过高,可能导致波段模糊或偏移。4)样品中杂志和期刊的含盐量和蛋白质过高会造成条带的模糊和缺失。5)核酸着色剂的稳定性和用量问题。实验室常用的核酸着色剂是溴化乙锭(EB),显色效果明显,可靠性差,有危害。疑似胶温50~60℃时加入EB。附之前实验的图,马克笔特别弱是因为马克笔用的时间太久了,带有点模糊。之后换缓冲液就好很多了。只是酱,一只做生物科学研究的狗,热烈欢迎讨论指正~
凝胶电泳是定性研究还是定量分析?
属于定性研究和半定量分析,属于前者更科学。
凝胶电泳也叫琼脂糖凝胶电泳,一般是在pcr(聚合酶链式反应)检测后,用来分析pcr产物的实验。如果pcr能正常增加所需时代的产物,即电泳后,凝胶在紫外光下的相应部位会出现相应的条带,如果不加物质,则没有条带。这属于定性研究。有时候实验者会根据条带的色度来判断效率的提高,大致得到基因的表达量,应该属于半定量范围。
为什么琼脂糖凝胶电泳的条带是弯曲的?
1.这条带子是伞状的。无论是目的基因的条带还是标记物的条带都是伞状的,根本原因是电泳液的琼脂糖凝胶旧配有问题。解决方法:重新配置电泳缓冲液,立即用琼脂糖凝胶更换新的电泳液。有必要注意适当的TAE提取物添加是否正确。初凝要充分,疑似凝胶要尽早使用。长期配制后禁止使用。
2.波段的偏差。目标基因的条带和标记的条带都是弯曲的,泳道是有偏差的。原因:琼脂糖凝胶装了有问题的凝胶,凝胶还没有凝结,凝胶放在电泳槽里偏了位置。
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